Процесс выделения у грибов растений и животных

Выделение у грибов растений и животных

Адрес редакции и издательства: 214000, РФ, г. Смоленск, ул. Верхне-Сенная, 4, офис 407.

Ответственность за разрешение любых спорных моментов, касающихся самих материалов и их содержания, берут на себя пользователи, разместившие материал на сайте. Однако редакция сайта готова оказать всяческую поддержку в решении любых вопросов, связанных с работой и содержанием сайта. Если Вы заметили, что на данном сайте незаконно используются материалы, сообщите об этом администрации сайта через форму обратной связи.

Все материалы, размещенные на сайте, созданы авторами сайта либо размещены пользователями сайта и представлены на сайте исключительно для ознакомления. Авторские права на материалы принадлежат их законным авторам. Частичное или полное копирование материалов сайта без письменного разрешения администрации сайта запрещено! Мнение редакции может не совпадать с точкой зрения авторов.

Вымирание растений - План урока ESL

1. ПОИСК СЛОВ: Посмотрите в своем словаре / компьютере, чтобы найти словосочетания, другие значения, информацию, синонимы ... для слов ...

'завод'

________________

________________

________________

________________

________________

________________

________________

________________

и «вымирание» .

________________

________________

________________

________________

________________

________________

________________

________________

• Поделитесь своими открытиями с партнерами.

• Задавайте вопросы, используя найденные слова.

• Задавайте вопросы партнеру / группе.

2.ВОПРОСЫ ПО СТАТЬЕ: Вернитесь к статье и запишите несколько вопросов, которые вы хотели бы задать классу по тексту.

3. ЗАПОЛНЕНИЕ ПРОБЕЛОВ: В парах / группах сравните свои ответы на это упражнение. Проверить ответы. Обсудите слова из упражнения. Были ли они новыми, интересными, заслуживающими изучения…?

4. СЛОВАРЬ: Обведите любые слова, которые вы не понимаете.В группах объединяйте неизвестные слова и используйте словари, чтобы найти их значения.

5. ТЕСТИРУЙТЕ ДРУГА: Посмотрите на слова ниже. Вместе со своим партнером попробуйте вспомнить, как они использовались в тексте:

• раскрыто
• штука
• Флора
• возраст
• найти
• возможно
• после
• будущее
• незащищенность
• зависит от
• проиграть
• акт

грибов | Определение, характеристики, типы и факты

Грибок , множественное число грибов , любой из примерно 144000 известных видов организмов царства грибов, включая дрожжи, ржавчину, головню, плесень, плесень и грибы. Есть также много грибоподобных организмов, в том числе слизевые плесени и оомицеты (водяные плесени), которые не принадлежат к царству грибов, но часто называются грибами. Многие из этих грибовидных организмов входят в королевство Хромиста.Грибы являются одними из наиболее широко распространенных организмов на Земле и имеют большое экологическое и медицинское значение. Многие грибы свободно обитают в почве или воде; другие образуют паразитические или симбиотические отношения с растениями или животными.

Популярные вопросы

Как грибы получают питание?

• Сапротрофные грибы получают пищу из мертвого органического материала и являются экологически полезными деструкторами.
• Паразитические грибы питаются живыми организмами (обычно растениями), вызывая болезни.
• Для питания оба типа грибов выделяют пищеварительные ферменты на питательную поверхность, на которой они растут. Ферменты расщепляют углеводы и белки, которые затем всасываются через стенки гиф.
• Некоторые паразитические грибы также производят специальные поглощающие органы, называемые гаусториями, для более глубокого проникновения в живые ткани хозяина.

Что такое спора гриба?

Почти все грибы образуют и выделяют огромное количество спор в рамках своего жизненного цикла.Споры являются основными репродуктивными единицами грибов и обычно представляют собой одиночные клетки. Они могут быть произведены либо непосредственно бесполым путем, либо косвенно половым путем. Споры обычно образуются в результате фрагментации мицелия или внутри специализированных структур (спорангии, гаметангии, спорофоры и т. Д.). Некоторые споры, особенно у примитивных грибов, имеют жгутики и могут плавать, хотя большинство из них неподвижны. Когда спора попадает в подходящее место, она прорастает и растет, образуя новую грибковую особь.

Где растут грибы?

Грибы растут в самых разных средах по всему миру. Большинство грибов наземные и встречаются во всех регионах с умеренным и тропическим климатом. Некоторые виды обитают в Арктике и Антарктике, обычно в составе лишайников. Почва, богатая органическими веществами, является идеальной средой обитания для многих видов, и лишь небольшое количество грибов встречается в более засушливых районах или в местах обитания с небольшим содержанием органических веществ или без них. Некоторые грибы паразитируют на растениях или животных и живут на своих хозяевах или внутри них, по крайней мере, часть своего жизненного цикла.Водные грибы обычно обитают в чистой прохладной пресной воде, хотя некоторые виды встречаются в слегка солоноватой воде, а некоторые процветают в сильно загрязненных ручьях.

Узнайте о важных характеристиках, отличающих грибы от растений и животных.

Грибы - это эукариотические организмы; т.е., их клетки содержат связанные с мембраной органеллы и четко определенные ядра. Исторически грибы были включены в царство растений; однако, поскольку в грибах отсутствует хлорофилл и они отличаются уникальными структурными и физиологическими особенностями (т.е. компонентами клеточной стенки и клеточной мембраны), они были отделены от растений. Кроме того, грибы четко отличаются от всех других живых организмов, включая животных, по основным способам вегетативного роста и потребления питательных веществ. Грибы растут из кончиков нитей (гиф), составляющих тела организмов (мицелий), и они переваривают органическое вещество извне, прежде чем впитать его в свой мицелий.

Хотя грибы и поганки (ядовитые грибы) ни в коем случае не являются самыми многочисленными или экономически значимыми грибами, их легче всего распознать. Латинское слово, обозначающее гриб, гриб (множественное число грибов ) стало обозначать всю группу. Точно так же изучение грибов известно как микология - широкое применение греческого слова, обозначающего гриб, mykēs . Другие грибы, кроме грибов, иногда собирательно называют плесенью, хотя этот термин лучше ограничивать грибами, представляющими собой плесень для хлеба.(Для получения информации о плесневых грибах, которые проявляют черты как животного, так и грибного мира, см. protist.)

Съедобные белые грибы ( Boletus edulis ). Белые грибы широко распространены в Северном полушарии и образуют симбиотические ассоциации с рядом видов деревьев.

Формирование новых видов | Биология I

Цели обучения

К концу этого раздела вы сможете:

• Определите виды и опишите, как виды идентифицируются как разные
• Описать генетические переменные, которые приводят к видообразованию
• Выявление презиготических и постзиготных репродуктивных барьеров
• Объясните аллопатрическое и симпатрическое видообразование
• Описание адаптивного излучения

Хотя все живое на Земле имеет различное генетическое сходство, только некоторые организмы объединяют генетическую информацию путем полового размножения и дают потомство, которое затем может успешно воспроизводиться.Ученые называют такие организмы членами одного биологического вида.

Виды и способность к воспроизводству

Вид - это группа отдельных организмов, которые скрещиваются и производят плодовитое жизнеспособное потомство. Согласно этому определению, один вид отличается от другого, когда в природе спаривания между особями каждого вида не могут дать плодовитого потомства.

Члены одного и того же вида обладают как внешними, так и внутренними характеристиками, которые определяются их ДНК.Чем ближе отношения между двумя организмами, тем больше у них общего ДНК, как у людей и их семей. ДНК людей, скорее всего, будет больше похожа на ДНК их отца или матери, чем на ДНК их двоюродного брата или дедушки или бабушки. У организмов одного вида самый высокий уровень выравнивания ДНК и, следовательно, общие характеристики и поведение, которые приводят к успешному воспроизводству.

Внешний вид вида может вводить в заблуждение, предполагая способность или неспособность к спариванию. Например, несмотря на то, что домашние собаки ( Canis lupus knownis ) демонстрируют фенотипические различия, такие как размер, телосложение и шерсть, большинство собак могут скрещиваться и производить жизнеспособных щенков, которые могут созревать и воспроизводиться половым путем (рис. 1).

для растений с высоким уровнем вторичных метаболитов и полисахаридов без использования жидкого азота и фенола

Известно, что мангровые заросли и виды солончаков синтезируют широкий спектр полисахаридов и полифенолов, включая флавоноиды и другие вторичные метаболиты, которые мешают экстракции чистая геномная ДНК. Хотя существует множество протоколов выделения ДНК растений, выделение ДНК из мангровых зарослей и видов солончаков является сложной задачей.В этом исследовании описывается быстрый и надежный протокол бромида цетилтриметиламмония (CTAB), специально предназначенный для извлечения ДНК из растений, богатых полисахаридами и вторичными метаболитами, и протокол также исключает использование дорогостоящего жидкого азота и токсичных фенолов. Чистота экстрагированной ДНК была превосходной, о чем свидетельствует соотношение А260 / А280 от 1,78 до 1,84 и соотношение А260 / А230> 2, что также свидетельствует о том, что препараты в достаточной степени не содержат белков и полифенольных / полисахаридных соединений.Концентрация ДНК варьировала от 8,8 до 9,9 μ г μ L ⁻¹ . Экстрагированная ДНК подвергалась RAPD, рестрикционному перевариванию и ПЦР-амплификации генов штрих-кода растений (matK и rbcl). Оптимизированный метод подходит как для сухих, так и для свежих листьев. Успех этого метода в получении высококачественной геномной ДНК продемонстрировал широкую применимость этого метода.

1. Введение

Выделение чистой, неповрежденной и высококачественной ДНК очень важно для любых молекулярных исследований [1].Однако выделение ДНК из растений обычно затрудняется чрезмерным загрязнением вторичными метаболитами. Методы выделения ДНК необходимо адаптировать для каждого вида растений и даже для каждой ткани растения из-за присутствия этих метаболитов, в отличие от животных и микробов [2]. Поиск более эффективных способов извлечения ДНК как более высокого качества, так и урожайности привел к разработке нескольких протоколов выделения ДНК из растений, содержащих высокие уровни вторичных метаболитов [3–7].Мангровые заросли и солончаки специально приспособлены к суровым условиям, таким как болотистая аноксидная анаэробная почва и колеблющаяся соленость водоемов [8]. Чтобы избежать этих стрессовых условий, мангровые заросли и солончаки синтезируют большое количество полисахаридов, полифенолов и других вторичных метаболитов, таких как алкалоиды и флаваноиды, которые препятствуют экстракции ДНК [9, 10].

Многие факторы могут вызвать сдвиг ДНК во время экстракции. Расщепление ДНК под действием эндонуклеаз - одна из таких проблем, с которыми сталкиваются при выделении и очистке высокомолекулярной ДНК из растений, которая прямо или косвенно мешает ферментативным реакциям [11].Полисахариды могут быть особенно проблематичными, когда они присутствуют в образцах ДНК, поскольку их присутствие также может подавлять ферментативную активность. Было показано, что присутствие полисахаридов ингибирует активность полимеразы Taq [12] и активность рестрикционных ферментов [13]. Присутствие полисахаридов в образце ДНК характеризуется образованием высоковязкого раствора [14]. Окисленная форма полифенолов ковалентно связывается с ДНК, придавая ей коричневый цвет, и сокращает время обслуживания, что делает ее бесполезной для молекулярных исследований [15].

Помимо традиционных подходов к экстракции, также доступны несколько коммерческих наборов для выделения геномной ДНК из растений с достаточным качеством [16]. Для извлечения геномной ДНК первоначальное механическое измельчение образца листа проводят в присутствии жидкого азота, конечная цель которого - получить доступ к ядерному материалу без разрушения. Многие протоколы выделения ДНК используют фенол для отделения клеточных молекул и остатков от ДНК, которая является токсичной, опасной, дорогой и требует специальных средств сдерживания для максимальной безопасности персонала и сведения к минимуму экологических проблем.Однако удобство, обеспечиваемое вышеупомянутыми способами, может быть непомерно дорогостоящим при рассмотрении экспериментов с ограниченными финансовыми ресурсами.

Несколько исследователей попытались отказаться от использования опасных химикатов, дорогих наборов, оборудования и трудоемких шагов для высокопроизводительной экстракции ДНК. Однако у этих методов есть недостатки, такие как ограниченный срок хранения, низкая чистота, низкое извлечение и плохая амплификация [17, 18]. В основном протоколы экстракции ДНК рекомендуют образцы свежих листьев для выделения геномной ДНК, но это кажется непрактичным, когда образцы собираются из отдаленных и редких мест.Эти ситуации требуют разработки протоколов для выделения ДНК из образцов высушенных листьев. Целью этого исследования было разработать простой метод выделения ДНК в открытой лабораторной среде, метод, который исключает необходимость использования жидкого азота и токсичного фенола. Полученный в результате оптимизированный протокол CTAB (цетилтриметиламмонийбромид) позволяет выделить высококачественную геномную ДНК, поддающуюся RAPD (случайная амплифицированная полиморфная ДНК), рестрикционное переваривание и амплификацию генов штрих-кода растений (matK и rbcl) с меньшими затратами и проблемами со здоровьем.

2. Материалы и методы

2.1. Образцы растений для выделения ДНК

Молодые, нежные и неповрежденные листья мангровых зарослей ( Rhizophora mucronata, Rhizophora apiculata, Aegiceras corniculatum, Lumnitzera racemosa, Lumnitzera littorea, Bruguiera officiniacylricindina, Avi-coli, Avi-coli, Avi-coli, Hydrophysical, Av. Xylocarpus mekongensis ) и солончак ( Suaeda maritima и Sesuvium portulacastrum ) были собраны в мангровом лесу Пичаварам, Тамил Наду, Индия, и хранили при -80 ° C до использования.Листья были предпочтительны для экстракции ДНК из-за их постоянной доступности круглый год. От каждого рода брали не менее десяти образцов. Сушеные листья Rhizophora и Avicennia sp. также были взяты для тщательной проверки применимости оптимизированного протокола экстракции.

ПЦР-амплификация matK (trnK-F: gggttgctaactcaatggtagag; trnK-R: tgggttgcccggggccgaac) и rbcl (rbcl-F: actgtagtagtaggtaaacttaggtaaacttgaaggtgaacg3, содержащая rbcl-F: реакция, содержащая 25Actagtagtgaaccg; rbclactaggtagtgaacg3, содержащая 25Actacta, была проведена в 1.0; ДНК-полимераза Taq , 1 мМ dNTPs-Mix, 1X буфер Taq , 2,5 мМ MgCl ₂ , 20 мМ каждого праймера для амплификации и 10-50 нг матричной ДНК в одноэтапной программе Touchdown PCR (1 цикл: 90 секунд при 96 ° C, 60 секунд при 50 ° C, 120 секунд при 68 ° C, 35 циклов: 30 секунд при 95 ° C, 60 секунд при 48 ° C, 120 секунд при 68 ° C, последующее окончательное удлинение 20 мин при 68 ° С) [23].Температура отжига () составляла от 47 до 50 ° С для разных видов растений. Амплифицированные продукты разделяли электрофорезом в 1,5% агарозном геле, забуференном 1X TAE. Гели окрашивали бромидом этидия, и полосы наблюдали в системе документации гелей (Alpha Innotech).

3. Результаты и обсуждение

Набор для экстракции геномной ДНК растений (GeNei) не показал многообещающих результатов для видов мангровых зарослей и солончаков, о чем свидетельствует присутствие липких полисахаридов в осадке и срезанная полоса в агарозном геле.Мы столкнулись со многими трудностями, начиная с самого первого этапа лизиса клеток и заканчивая разделением ДНК в супернатанте и последующими реакциями, когда метод экстракции ДНК CTAB по Porebski et al. [4] и Дж. Дж. Дойл и Дж. Л. Дойл [19]. С высоковязкими и липкими гранулами было трудно обращаться, а коричневатый осадок указывал на загрязнение фенольными соединениями [24]. Количество ДНК, полученное с помощью этих протоколов, было очень низким, и качество большинства образцов также было низким. Соотношение A260 / A280 было меньше 1.6, то есть ниже оптимального предела 1,8 [25], что делает ДНК непригодной для молекулярных исследований. Но, что интересно, метод CTAB, описанный Saghai-Maroof et al. [20] дали лучший выход ДНК с точки зрения качества и количества из исследуемых растений. Следовательно, этот метод рассматривался с целью стандартизации при различных концентрациях трис-HCL, -меркаптоэтанола, NaCl и PVP (рис. 1).

Успех оптимизированного метода экстракции в получении высококачественной геномной ДНК из всех протестированных видов мангровых зарослей и солончаков продемонстрировал широкую применимость.Концентрация ДНК методом экстракции варьировала от 8,8 до 9,9 г / л ^-1 . Использование предварительно охлажденной ступки и пестика и хранимых образцов листьев при температуре −40 ° C / −80 ° C успешно заменило использование дорогостоящего жидкого азота. Конечные осадки ДНК были белыми без видимого изменения цвета. Сообщалось, что высокий уровень -меркаптоэтанола успешно удаляет полифенолы [26]. Поэтому использовалась высокая концентрация β -меркаптоэтанола, что сделало протокол пригодным для экстракции ДНК высокого качества.Известно, что добавление NaCl в концентрациях выше 0,5 М вместе с ЦТАБ удаляет полисахариды во время экстракции ДНК [24, 27]. Концентрация NaCl варьировалась в зависимости от вида растений в диапазоне от 0,7 М [28] до 6 М [29]. В настоящем исследовании более высокий уровень NaCl (1,5 М) в буфере для экстракции дополнительно улучшил качество экстрагированной ДНК. Высокое качество полученной ДНК также можно объяснить использованием более высокой концентрации ПВП (2,5%) с более низкой молекулярной массой (10 000), чем 40 000.Ряд исследователей [30, 31] рекомендуют использовать ПВП с молекулярной массой 10 000 при 2% (мас. / Об.) Для решения проблемы фенольных соединений. PVP с низкой молекулярной массой имеет меньшую тенденцию к преципитации с нуклеиновыми кислотами по сравнению с PVP с высокой молекулярной массой, что дает достаточное количество свободной от полифенолов ДНК [32].

Чистота экстрагированной ДНК была превосходной, о чем свидетельствует соотношение A260 / A280 в диапазоне от 1,78 до 1,84 и соотношение A260 / A230> 2, что свидетельствует о том, что препараты были достаточно свободными от белков и полифенольных / полисахаридных соединений [20].Четкие полосы полос наблюдались в исследовании RAPD (Рисунок 2). Извлеченную ДНК также можно было использовать для изучения ПДРФ и амплификации генов штрих-кода растений, как показано на рисунках 3 и 4 соответственно. Последовательности успешно амплифицированных генов штрих-кода были секвенированы и отправлены в Genbank (инвентарные номера: JQ433951, JQ421082, JQ511854 и JQ421083)

Свежие и молодые листовые материалы являются первым выбором для получения материалов хорошего качества. ДНК.Однако зрелые листья содержат большее количество полифенолов и полисахаридов [4], что затрудняет выделение ДНК хорошего качества. Однако доступность молодых листьев для молекулярных исследований для некоторых видов является сложной задачей. Преодоление этой проблемы с использованием настоящего оптимизированного протокола позволило получить ДНК лучшего качества даже из образцов высушенных листьев. Никакой фрагментации ДНК из-за сдвига ДНК во время процедуры экстракции не наблюдалось ни в одном из образцов, и результаты были воспроизводимы.Отсутствие мазков еще раз подтверждает высокую чистоту экстрагированной ДНК. Ранее сообщалось, что сдвиг ДНК во время экстракции может прямо или косвенно мешать ферментативным реакциям [11] во время различных молекулярных исследований, то есть ПЦР, ПДРФ, RAPD и так далее. Не наблюдалось ингибирования активности ДНК-полимеразы Taq . Повторная обработка хлороформом: обработка изоамиловым спиртом обеспечила удаление хлорофилла, пигментов и красителей. Этот протокол также может быть полезен для других видов растений с высоким содержанием полисахаридов и вторичных метаболитов в процессе экстракции ДНК.

4. Заключение

Здесь мы описали простой, безопасный, надежный и экономичный метод выделения ДНК CTAB, который обеспечивает получение высококачественной ДНК из непокорных мангровых зарослей и солончаков, содержащих повышенные концентрации полисахаридов и полифенольных соединений. Этот метод избавляет от необходимости использовать дорогостоящий жидкий азот и экологически опасный фенол для получения геномной ДНК высокого качества. Предлагаемый метод позволяет извлекать ДНК даже из засохших листьев мангровых зарослей и солончаков.Полученный в результате оптимизированный протокол CTAB позволяет изолировать геномную ДНК высокого качества, поддающуюся RAPD, RFLP, и амплифицировать гены штрих-кода растений (matK и rbcl). Поэтому этот метод рекомендуется даже в лабораториях с низкими технологиями для высокопроизводительной подготовки проб, подходящих для различных молекулярных аналитических методов.

Благодарности

Авторы благодарны властям Университета Аннамалай за предоставление помещений и Департаменту науки и технологий правительства Индии, Нью-Дели, за финансовую поддержку.

.

---

Смотрите также

• 
  Выделения желтые из попы
• 
  Белые выделения в уголках глаз у взрослых
• 
  Выделения с кровью после полового акта
• 
  Кровянистые выделения через месяц после лапароскопии
• 
  После повторного выскабливания выделения
• 
  Могут ли быть выделения при беременности на ранних сроках до задержки
• 
  После дюфастона коричневые выделения
• 
  Обильные белые выделения без запаха признак
• 
  Коричневые выделения при миоме
• 
  Когда после кесарева закончатся выделения
• 
  Выделения из уха новорожденного