• Станция для выделения днк


    Автоматизированные станции для выделения ДНК/РНК

    При использовании лабораторных станций Biomek Genomic вы достигнете более высокой согласованности и надежности выделения и очистки нуклеиновых кислот, чем при работе вручную. Автоматизируйте процедуры выделения и очистки на магнитных частицах, чтобы повысить качество образцов, используемых в последующих процессах, включая NGS-секвенирование , микроматричный анализ и количественную ПЦР.

    Обеспечьте более высокую производительность при выделении из крови, клеток, FFPE-образцов, тканей и других типов образцов. Объедините лабораторные станции Biomek Genomic с реагентами Beckman Coulter для геномных исследований, чтобы получить комплексное решение по выделению и очистке нуклеиновых кислот.

    Повышая эффективность и сокращая время ручного труда, лабораторные станции Biomek Genomic обеспечивают возможность максимально результативного планирования времени ваших сотрудников. Подтвержденные методы могут быть выполнены от начала и до конца без участия оператора, они могут включать в себя дополнительные точки запуска и остановки с учетом рекомендаций поставщика набора.

    Лабораторные станции Biomek Genomic, сконструированные на базе систем дозирования жидкостей Biomek 4000, Biomek i5 и Biomek i7, предлагают масштабируемые решения по автоматизации, которые могут содержать все необходимые этапы: от выделения до, например, создания библиотеки. Заранее установленные конфигурации для инструментов i-Series включают в себя возможность встроенной инкубации, очистки на магнитных частицах, перемешивания с помощью шейкера, а также установку дополнительных корпусов и термоциклирования внутри рабочей станции Biomek.

    Экстракция ДНК


    Создано Джорджем Райсом, Государственный университет Монтаны


    Рассел Хилл инструктирует студентов по извлечению ДНК на курсе SMaRT 2005 года. (изображение предоставлено Russell Hill, 2005 г.) Что такое экстракция ДНК?

    Проще говоря, экстракция ДНК - это удаление дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) из клеток или вирусов, в которых она обычно находится.

    Для чего это используется?

    Извлечение ДНК часто является ранним этапом многих диагностических процессов, используемых для обнаружения бактерий и вирусов в окружающей среде, а также для диагностики заболеваний и генетических нарушений.Эти методы включают, но не ограничиваются:

    • Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH): FISH - это молекулярный метод, который используется, среди прочего, для идентификации и подсчета конкретных бактериальных групп.
    • Полиморфизм длины конечного рестрикционного фрагмента (T-RFLP): T-RFLP используется для идентификации, характеристики и количественной оценки пространственных и временных закономерностей в сообществах морского бактериопланктона.
    • Секвенирование: могут быть секвенированы части или целые геномы, а также дополнительные хромосомные элементы для сравнения с существующей последовательностью в общедоступной базе данных.


    Как это работает?

    Схема базовой экстракции ДНК -

    1. Взломайте (лизируйте) клетки или вирус, содержащие интересующую ДНК -
      Это часто делается обработкой ультразвуком или взбиванием образца шариками. Перемешивание с фенолом (иногда нагретым) часто эффективно для разрушения прочных клеточных стенок или вирусных капсидов. Добавление детергента, такого как SDS, часто необходимо для удаления липидных мембран.
    2. ДНК-ассоциированные белки, как и другие клеточные белки, могут разрушаться при добавлении протеазы.Осаждению белка способствует добавление соли, такой как ацетат аммония или натрия. Когда образец встряхивают с фенол-хлороформом и центрифугируют, белки остаются в органической фазе, и их можно осторожно отобрать. ДНК будет находиться на границе между двумя фазами.
    3. ДНК
    4. осаждают путем смешивания с холодным этанолом или изопропанолом и последующего центрифугирования. ДНК нерастворима в спирте и выходит из раствора, а спирт служит промывкой для удаления ранее добавленной соли.
    5. Снова промойте полученный осадок ДНК холодным спиртом и центрифугируйте для извлечения осадка.
    6. После слива спирта с осадка и сушки ДНК можно повторно суспендировать в буфере, таком как Трис или ТЕ.
    7. Наличие ДНК может быть подтверждено электрофорезом на агарозном геле, содержащем бромид этидия или другой флуоресцентный краситель, который реагирует с ДНК, и проверкой в ​​УФ-свете.

    Изображение вирусной ДНК, подвергнутой электрофорезу в агарозном геле.ДНК экстрагировали из теплового вируса STIV и разрезали тремя отдельными рестрикционными ферментами. (рисунок предоставлен автором)

    Инструменты, используемые для экстракции ДНК - Это устройство для взбивания гранул используется для разрушения или «лизиса» клеток на ранних этапах экстракции, чтобы сделать ДНК доступной. Стеклянные шарики добавляют в пробирку эппендорфа, содержащую интересующий образец, и взбиватель для шариков энергично вибрирует раствор, заставляя стеклянные шарики физически разрушать клетки.Другие методы, используемые для лизиса клеток, включают френч-пресс и устройство для обработки ультразвуком. Центрифуга , такая как эта, может вращаться со скоростью до 15000 об / мин для облегчения разделения различных фаз экстракции. Он также используется для осаждения ДНК после смывания солей этанолом и / или изопропанолом. Коробка с гелем используется для разделения ДНК в агарозном геле с электрическим зарядом. Когда красный и черный провода подключены к источнику питания, ДНК мигрирует через гель в сторону положительного заряда из-за чистого отрицательного заряда молекулы.Части ДНК разного размера движутся с разной скоростью, при этом более крупные части движутся медленнее через пористую среду, тем самым создавая разделение по размеру, которое можно различить в геле.

    Ссылки по теме


    • Справочная страница, дающая обзор ДНК и важности этой молекулы в современной молекулярной биологии.

    Преподавательская деятельность


    • Серия лабораторных упражнений с инструкциями по выделению ДНК из нескольких различных исходных материалов.Упражнение рассчитано на учащихся 6–12 классов.
    Следующие ресурсы были первоначально доступны через коллекцию цифровых ресурсов BioSciEd Net (BEN), которая представляет собой путь Национальной научной цифровой библиотеки (NSDL) для образования в области биологических наук. Дополнительные учебные ресурсы можно найти на сайте BEN, чтобы использовать их базу данных с возможностью поиска. BEN можно использовать бесплатно, но требуется регистрация.
    • Выделение ДНК из лука - Эта лаборатория от AccessExcellence позволяет студентам конкретно работать с ДНК, легко выделяя хромосомную ДНК с помощью тех же основных инструментов и методов, которые используют ученые.
    • Извлечение ДНК - этот веб-сайт Science NetLinks предлагает планы уроков, которые развивают понимание ДНК путем моделирования процесса извлечения ДНК.
    • [ссылка https://web.archive.org/web/20190222033127/http://www.apsnet.org/edcenter/K-12/TeachersGuide/DNA_Easy/Pages/default.aspx «Легкий путь ДНК (и Грамм Пятно без беспорядка »] - этот ресурс Американского фитопатологического общества представляет собой короткое лабораторное упражнение, которое обучает студентов процедурам выделения ДНК из бактериальных клеток.Кроме того, студенты узнают, как определять реакцию бактериальных изолятов окрашиванием по Граму.
    • ДНК-детективы: этот ресурс Access Excellence предоставляет лабораторные занятия, где студенты используют анализ ДНК-отпечатков пальцев для определения виновника фиктивного преступления.
    • Используйте ПЦР и один волос для получения отпечатка ДНК - этот ресурс требует, чтобы вы вошли в систему BEN для просмотра (для этого требуется подписка на BEN, которая является бесплатной). Этот документ в формате PDF предлагает подробное руководство по протоколам и инструктивную информацию для выполнения студентами лабораторных занятий по молекулярной биологии и ценетике, в которых студенты используют полимеразную цепную реакцию для создания отпечатков пальцев ДНК из своих собственных волос.Он включает в себя конспекты студентов, заметки инструктора и предлагаемые вопросы для лабораторных отчетов.
    .

    Автоматическая система экстракции ДНК (РНК, ДНК, белки и генетика)

    Система экстракции была разработана для использования коммерческих наборов, которые извлекают ДНК, РНК и белки из различных источников, включая:

    • Почва
    • Растения
    • Бактерии
    • Кровь
    • Моча
    • Слюна
    • и более…

    В системе можно использовать любой или все из ваших любимых методов разделения, в том числе:

    • вакуумная фильтрация
    • фильтрация под давлением
    • магнитный сепаратор
    • центрифугирование

    Полезность системы экстракции может быть значительно увеличена за счет добавления дополнительного оборудования в зону действия манипулятора робота для добавления прямой последующей обработки очищенных биомолекул.Вот несколько примеров потенциальной универсальности комбинации вытяжной системы с дополнительным оборудованием:

    • Термоциклер : прямая амплификация выделенной и очищенной ДНК (ПЦР).
    • УФ-спектрометр : Измерьте концентрацию очищенных белков.
    • Считыватель динамического рассеяния света (DLS) : Измерьте размер и / или агрегатное состояние каждого образца.
    .

    Автоматизированная система выделения ДНК OKtopure

    oKtopure ™ - это роботизированная платформа, которая сочетает в себе стандартизацию высокопроизводительной экстракции ДНК из тканей растений с запатентованной химией экстракции на основе магнитных шариков sbeadex ™.

    Ключом к доставке высококачественных препаратов ДНК с высоким выходом из oKtopure является его способность связывать и удерживать магнитные шарики и, следовательно, ДНК на месте при переносе буферов, необходимых для стадий промывки, связывания и элюирования.Последняя водная промывка, используемая в протоколах экстракции sbeadex, позволяет доставлять нуклеиновые препараты, идеально подходящие для последующих применений, таких как генотипирование SNP и секвенирование NGS и Sanger.

    Доступность автономной станции промывки наконечников является ключевой особенностью автоматизированной системы экстракции ДНК oKtopure, которая обеспечивает экономию расходных материалов на до 50% за счет повторного использования наконечников в ходе до 40 циклов экстракции ДНК.

    Основные характеристики oKtopure

    • Полностью автоматизированная платформа для экстракции растительной ткани на основе sbeadex
      • 8 x 96 пластин / 1 - 1.5 часов для мини-экстракций sbeadex (20-30 мг исходного материала)
      • 8 x 96 чашек / 2,5 часа или экстракция sbeadex maxi (80-100 мг исходного материала)
    • Увеличивает производительность и эффективность экстракции с использованием химии sbeadex (формат мини и макси)
    • Эффективное использование лабораторного пространства
      • Малый формат: 170 см x 68,5 см x 65 см
    • Возможность автономной мойки наконечников сокращает расходы на расходные материалы за счет повторного использования наконечников
    • Совместимость с существующими установками SNPline
    • Дозирующая головка с регулируемым Z-положением облегчает использование планшетов с мелкими и глубокими лунками.
    • Индивидуальные или предустановленные протоколы, подходящие для самых разных образцов материалов.
    .

    Понимание роли протеаз в экстракции ДНК

    • О КОМПАНИИ
    • СПИСОК ЦЕН
    • ПОИСК ЛИТЕРАТУРЫ
    • СВЯЗАТЬСЯ С НАМИ
    • ВХОД
      • ВХОД
      • РЕГИСТР
    • ПРОТЕОМИКА
      • Моющие средства и аксессуары
        • Каликсареновые поверхностно-активные вещества
        • Растворы моющих средств Proteomic
        • Неионные детергенты
        • Ионные моющие средства
        • Цвиттерионные моющие средства
        • Системы удаления моющих средств
        • 2D-Моющие средства
        • Фторированные поверхностно-активные вещества
        • Принадлежности
      • Сшивание белков и модификация белков
        • Белковые кросслинкеры
        • Восстанавливающие реагенты
    .

    Смотрите также